Últimamente no entiendo por qué UTF8 no es el encoding por defecto en todos los sistemas. Bueno, es simplemente una decisión de diseño y utilizar cualquier otro encoding es perfectamente defendible (por las mismas razones por las que existen, optimización local).
Sea como sea, en todo proyecto en el que he participado, lo primero que se hace es intentar encontrar todos esos parametros que ajustan el encoding para indicar que se use UTF8. La tarea no suele ser trivial y siempre se escapa alguno, pero todo es cuestion de tiempo y de incidencias de los usuarios.
Uno de los primeros pasos por supuesto es configurar nuestro editor. En mi caso soy un usuario de Eclipse y apenas sé que es eso de NetBeans o IntelliJ.
